Vandens lelijos platina šakniastiebius ir šaknis, kurios įtvirtina augalą giliai tylaus, gėlo paviršinio vandens purve. Šaknys sunaudoja maistines medžiagas, taip pat mažas vandens atsargas. Jiems nereikia vartoti didelių vandens atsargų, nes augalas yra panardintas; apatinė lapų dalis taip pat gali paimti vandenį.
Vandens lelijos skleidžia šakniastiebius šakniastiebiais.Hardy vandens lelija
Hardy vandens lelijosKai kietos vandens lelijos stiebai, lapai ir žiedai nukenčia nuo šalčio ir žūva, šaknys lieka saugiai pritvirtintos po vandeniu, kur temperatūra nenukrinta žemiau užšalimo. Kiekvieną pavasarį augalas iš naujo iš šaknų vėl pasirodo, jei visas vandens baseinas neužšąla.
Atogrąžų vandens lelija
Atogrąžų vandens lelijosŠalčiai gali užmušti visą atogrąžų vandens leliją, įskaitant šaknis. Šaknys turi būti padengtos bent pėda nejudančio, gėlo vandens. Kai kurios atogrąžų vandens lelijos augina gumbus šalia vainiko, kuriuos galima skinti ir sodinti naujoms vandens lelijoms.
Šakniastiebių prigimtis
Šakniastiebiai iš tikrųjų yra požeminiai stiebai, daugiausia naudojami laikyti. Vandens lelijos šakniastiebiai nekaupia angliavandenių ir baltymų ramybės periodais, ypač žiemą. Pavasarį šakniastiebiai išskiria aminorūgštis ir angliavandenius, kad palaikytų greitą ūglių augimą, kol bus pakankamai lapų, kurie galėtų perimti maisto gamybą.